آنچه که سازمان پژوهش های علمی و صنعتی ایران برای تشویق و حمایت از برگزیدگان  سی و نهمین جشنواره بین ­المللی خوارزمی انجام می­ دهد عبارت است از:

1- لوح تقدیر ریاست محترم جمهوری اسلامی ایران

2- لوح تقدیر وزیر محترم علوم، تحقیقات و فناوری

3- جایزه نقدی سازمان پژوهش­ های علمی و صنعتی ایران

•     رتبه اول 6/000/000/000 ریال
•     رتبه دوم 5/000/000/000 ریال
•    رتبه سوم 4/000/000/000 ریال

4- تندیس جشنواره ­­های خوارزمی

5- صدور گواهی­نامه کسب رتبه در جشنواره­­ های خوارزمی 

6- عضویت و استفاده از تسهیلات بنیاد ملی نخبگان مطابق با آئین­ نامه بنیاد

7-  معرفی برگزیدگان به سازمان سنجش برای استفاده از تسهیلات مطابق با آئین ­نامه سازمان سنجش

8- معرفی برگزیدگان به پارک های علم و فناوری و صندوق های حمایتی در راستای تجاری سازی طرح برگزیده